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walke committed Feb 2, 2021
1 parent 7a70ad8 commit d0c2e8a
Showing 8 changed files with 11 additions and 8 deletions.
4 changes: 2 additions & 2 deletions DESCRIPTION
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,8 +1,8 @@
Package: MosaicPlotCovid19
Type: Package
Title: Create a Mosaic plot for weekly Covid-19 death counts using R
Version: 0.7.0
Date: 2020-11-20
Version: 0.8.0
Date: 2021-02-02
Authors@R: c(person("Rainer", "Walke", role = c("aut", "cre"),
email = "walke@demogr.mpg.de",
comment = c(ORCID = "0000-0002-4269-6531")))
7 changes: 4 additions & 3 deletions README.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -11,15 +11,16 @@ This first program is based on Covid-19 data collected in the COVID-19 Data Repo
Reporting criteria varies between different countries.

The program computes weekly sums of deaths and produces Mosaic plots using R.
All regions with a total Covid-19 death toll of at least 1000 are included.
Every seventh week is couloured yellow to make the comparison easier.
All regions with a smaller Covid-19 death toll are pooled into a 5%-percentile category (5% of all reported deaths).
Every seventh week is coloured yellow to make the comparison easier.
The maximum weekly death toll is denoted.

A second program produces a similar Mosaic plot with a different data source.
ECDC (https://opendata.ecdc.europa.eu/covid19/) provides world wide Covid-19 statistics.
A variant graph orders the regions depending on the calendar week with maximum death toll.
But reporting criteria differ between countries as well.
To take into account the different population sizes, an extension adds empty spaces to normalize the weekly deaths toll to the population of the regions. The regions with the highest weekly mortality rate in a certain week does not get any additional empty space in that week.

A third program is using data from (https://corona.rki.de) Germany. As an extension that third program generates
a Mosaic plot for Covid-19 cases instead of deaths as well.
To take into account the different population sizes, another extension adds empty spaces to normalize the weekly deaths toll to the population of the Bundesländer. The Bundesland with the highest weekly mortality rate in a certain week does not get any additional empty space in that week.
Similar to the ECDC data a second extension adds empty spaces to normalize the weekly deaths toll to the population of the Bundesländer.
Binary file modified covid19_weekly_cases_GER_16.pdf
Binary file not shown.
Binary file modified covid19_weekly_deaths_4regions.pdf
Binary file not shown.
Binary file modified covid19_weekly_deaths_95P_CSSE.pdf
Binary file not shown.
Binary file modified covid19_weekly_deaths_GER_16.pdf
Binary file not shown.
Binary file modified covid19_weekly_deaths_norm_GER_16.pdf
Binary file not shown.
8 changes: 5 additions & 3 deletions translations/README.de.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -10,14 +10,16 @@ Das erste Programm nutzt Covid-19-Daten, die aus der COVID-19-Datensammlung des
Center for Systems Science and Engineering (CSSE) an der Johns Hopkins University (https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19.git) stammen.
Die Berichtskriterien variieren zwischen den einzelnen Ländern.

Das Programm berechnet wöchtentliche Sterbefallsummen und erzeugt Mosaik-Plots mit Hilfe der Programmiersprache R.
Alle Regionen mit einer Gesamtanzahl von Covid-19-Verstorbenen ab 1000 sind einbezogen. Jede siebte Woche is gelb markiert um den Vergleich einfacher zu machen. Das Wochenmaxium ist extra beschriftet.
Das Programm berechnet wöchentliche Sterbefallsummen und erzeugt Mosaik-Plots mit Hilfe der Programmiersprache R.
Alle Regionen mit kleineren Zahlen von Covid-19-Verstorbenen werden in eine 5%-Perzentil-Kategorie zusammengefasst (5% aller gemeldeten Sterbefälle).
Jede siebte Woche ist gelb markiert um den Vergleich einfacher zu machen. Das Wochenmaximum ist extra beschriftet.

Ein zweites Programm erzeugt ähnliche Mosaik-Plots aus einer anderen Datenquelle.
ECDC (https://opendata.ecdc.europa.eu/covid19/) stellt Covid-19-Statistiken für die ganze Welt zur Verfügung.
Eine zusätzliche, abgewandelte Grafik sortiert die Regionen nach der Kalenderwoche mit der höchsten Todesfallzahl.
Auch hier variieren die Berichtskriterien zwischen den einzelnen Ländern.
Eine Erweiterung normalisiert für die unterschiedlichen Bevölkerungsanzahl in den Regionen. Dazu wird Leerraum eingefügt. Die Region mit der höchsten Sterberate der jeweiligen Woche bekommt keinen zusätzlichen Leerraum.

Ein drittes Programm nutzt Daten von (https://corona.rki.de) (RKI Deutschland).
Es erzeugt ähnliche Mosaik-Plots für die 16 Bundesländer in Deutschland. Als zusätzliche Erweiterung wird anstatt der Todesfälle auch ein Mosaik-Plot für die Covid-19-Fälle erstellt.
Eine andere Erweiterung normalisiert für die unterschiedlichen Bevölkerungsanzahl in den Bundesländern. Dazu wird Leerraum eingefügt. Das Bundesland mit der höchsten Sterberate der jeweiligen Woche bekommt keinen zusätzlichen Leerraum.
Ähnlich wie bei den ECDC-Daten normalisiert eine zweite Erweiterung für die unterschiedlichen Bevölkerungsanzahl in den Bundesländern.

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